{"id":6095,"date":"2021-09-01T10:48:53","date_gmt":"2021-09-01T14:48:53","guid":{"rendered":"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/?page_id=6095"},"modified":"2021-09-01T10:58:38","modified_gmt":"2021-09-01T14:58:38","slug":"podcast-11","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/index.php\/podcast-11\/","title":{"rendered":"Podcast 11"},"content":{"rendered":"\n<p style=\"font-size:clamp(16.293px, 1.018rem + ((1vw - 3.2px) * 0.771), 25px);px\">Title: &#8220;<em>Genome-wide association&nbsp;studies (GWAS)<\/em> en la investigaci\u00f3n&nbsp;neuropsiqui\u00e1trica&#8221;<\/p>\n\n\n\n<p>By Diego R. Calo L\u00f3pez<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height:25px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-cover alignwide has-background-dim-30 has-neve-link-color-background-color has-background-dim has-custom-content-position is-position-center-left is-position-center-center\" style=\"min-height:250px;aspect-ratio:unset;\"><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" width=\"2000\" height=\"1125\" class=\"wp-block-cover__image-background wp-image-5743\" alt=\"\" src=\"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/Podcastbackground.png\" style=\"object-position:7% 61%\" data-object-fit=\"cover\" data-object-position=\"7% 61%\" srcset=\"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/Podcastbackground.png 2000w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/Podcastbackground-300x169.png 300w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/Podcastbackground-1024x576.png 1024w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/Podcastbackground-768x432.png 768w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/Podcastbackground-1536x864.png 1536w\" sizes=\"(max-width: 2000px) 100vw, 2000px\" \/><div class=\"wp-block-cover__inner-container is-layout-flow wp-block-cover-is-layout-flow\">\n<div style=\"height:28px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-columns is-layout-flex wp-container-core-columns-is-layout-28f84493 wp-block-columns-is-layout-flex\">\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\" style=\"flex-basis:35%\">\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"aligncenter size-large is-resized\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Diego-edited.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-6096\" width=\"285\" height=\"285\" srcset=\"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Diego-edited.png 396w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Diego-edited-300x300.png 300w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Diego-edited-150x150.png 150w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Diego-edited-45x45.png 45w\" sizes=\"(max-width: 285px) 100vw, 285px\" \/><\/figure><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\" style=\"flex-basis:50%\">\n<div style=\"height:24px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<p class=\"has-nv-dark-bg-color has-text-color\" style=\"font-size:clamp(20px, 1.25rem + ((1vw - 3.2px) * 1.062), 32px);px\">Genome-wide association studies <\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-nv-dark-bg-color has-text-color\" style=\"font-size:clamp(20px, 1.25rem + ((1vw - 3.2px) * 1.062), 32px);px\">en la investigaci\u00f3n neurocient\u00edfica<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-nv-dark-bg-color has-text-color\"><em>La investigaci\u00f3n cient\u00edfica de los des\u00f3rdenes mentales, y las herramientas modernas que se estan utilizando para avanzar nuestro conocimiento sobre la gen\u00e9tica detr\u00e1s de los des\u00f3rdenes mentales.<\/em>.. <\/p>\n\n\n\n<div style=\"height:21px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-columns is-layout-flex wp-container-core-columns-is-layout-28f84493 wp-block-columns-is-layout-flex\">\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\">\n<figure class=\"wp-block-audio aligncenter\"><audio controls src=\"https:\/\/d3ctxlq1ktw2nl.cloudfront.net\/staging\/2021-8-1\/c16098b2-774e-3e36-1c8b-7364f7d54f43.mp3\"><\/audio><\/figure>\n\n\n\n<div style=\"height:17px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-buttons is-layout-flex wp-block-buttons-is-layout-flex\">\n<div class=\"wp-block-button\"><a class=\"wp-block-button__link has-neve-link-color-background-color has-background\" href=\"https:\/\/anchor.fm\/neuro-id\/episodes\/Podcast-Genome-wide-association-studies-GWAS-en-la-investigacin-neurocientfica-e16oudr\" style=\"border-radius:50px\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Podcast audio<\/a><\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div><\/div>\n\n\n\n<div style=\"height:30px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-file aligncenter\"><a href=\"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Genome-wide-association-studies-en-la-investigacion-neuropsiquiatrica.pptx.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Genome wide association studies <em>en la investigacion-neuropsiquiatrica<\/em><\/a><a href=\"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Genome-wide-association-studies-en-la-investigacion-neuropsiquiatrica.pptx.pdf\" class=\"wp-block-file__button\" download>OPEN PRESENTATION<\/a><\/div>\n\n\n\n<div style=\"height:47px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<hr class=\"wp-block-separator\"\/>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-columns is-layout-flex wp-container-core-columns-is-layout-28f84493 wp-block-columns-is-layout-flex\">\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\" style=\"flex-basis:15%\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\">\n<div class=\"wp-block-columns is-layout-flex wp-container-core-columns-is-layout-28f84493 wp-block-columns-is-layout-flex\">\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\">\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignright size-large is-resized\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Screen-Shot-2021-09-01-at-10.37.00-AM-edited.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-6098\" width=\"300\" srcset=\"https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Screen-Shot-2021-09-01-at-10.37.00-AM-edited.png 430w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Screen-Shot-2021-09-01-at-10.37.00-AM-edited-300x300.png 300w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Screen-Shot-2021-09-01-at-10.37.00-AM-edited-150x150.png 150w, https:\/\/neuroid.uprrp.edu\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Screen-Shot-2021-09-01-at-10.37.00-AM-edited-45x45.png 45w\" sizes=\"(max-width: 430px) 100vw, 430px\" \/><\/figure><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-column is-vertically-aligned-center is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\">\n<p class=\"has-medium-font-size\">Diego R. Calo L\u00f3pez<\/p>\n\n\n\n<p>University of Puerto Rico, Rio Piedras Campus<br>Faculty: Natural Science<br>Baccalaureate: Biology <br>Year: 4th<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\" style=\"flex-basis:15%\"><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n<hr class=\"wp-block-separator\"\/>\n\n\n\n<div style=\"height:51px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-columns is-layout-flex wp-container-core-columns-is-layout-28f84493 wp-block-columns-is-layout-flex\">\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\" style=\"flex-basis:25%\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\" style=\"flex-basis:50%\">\n<h1 class=\"wp-block-heading\">Transcript (in spanish)<\/h1>\n\n\n\n<p>Saludos a todos y todas los podcast escucha a trav\u00e9s de todo el mundo. Este que les habla es Diego Calo L\u00f3pez, y soy estudiante subgraduado de biolog\u00eda en la Universidad de Puerto Rico, Recinto de R\u00edo Piedras tomando un curso sobre la neurobiolog\u00eda de los des\u00f3rdenes mentales. En este episodio les quiero hablar sobre la investigaci\u00f3n cient\u00edfica de los des\u00f3rdenes mentales, y las herramientas modernas que se estan utilizando para avanzar nuestro conocimiento sobre la gen\u00e9tica detr\u00e1s de los des\u00f3rdenes mentales. Pero, antes de hablar sobre este tema, quisiera contarles una breve historia de c\u00f3mo es que se descubri\u00f3 el primer tratamiento moderno para la depresi\u00f3n. Todo empez\u00f3 cuando se estaba probando un medicamento para tratar la tuberculosis que inhibe la oxidaci\u00f3n de monoaminas, las MAOs, que son enzimas que degradan las monoaminas. Este medicamento, que era un antibi\u00f3tico, cuando se le administraba a los pacientes depresivos que ten\u00edan tuberculosis, estos mostraban un cambio muy favorable en su humor. Un a\u00f1o m\u00e1s tarde, se hizo otro estudio con este mismo medicamento pero en pacientes depresivos sin tuberculosis. Los resultados de este estudio eran evidentes: los pacientes mostraban un gran mejoramiento en sus sintomas de depresion. Esto llev\u00f3 a los neurocient\u00edficos a entender que si se inhibe la oxidasa de monoaminas, se aumentaba la concentraci\u00f3n de las monoaminas en el espacio sin\u00e1ptico y, de alguna forma, esto hace que mejore los s\u00edntomas en pacientes que sufr\u00edan de depresi\u00f3n.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Este descubrimiento de medicamentos antidepresivos fue evidentemente sin querer, y fue hace m\u00e1s de 60 a\u00f1os atr\u00e1s! Y, lo m\u00e1s sorprendente de todo, todav\u00eda no se conoce con certeza c\u00f3mo es que los medicamentos antidepresivos funcionan. Esta an\u00e9cdota sirve como un ejemplo de lo poco que se sabe sobre las enfermedades mentales. Dentro de lo poco que se sabe sobre las enfermedades mentales, especialmente las m\u00e1s comunes como la depresi\u00f3n, esquizofrenia, des\u00f3rdenes de ansiedad y bipolaridad, se debe a que estas son polig\u00e9nicas. La mayor\u00eda de los des\u00f3rdenes mentales tienen cientos de genes de riesgo que interact\u00faan entre s\u00ed que resultan en un fenotipo, o en una enfermedad. Estos genes de riesgo, por s\u00ed solos, no tienen efecto significativo en el desorden mental. Es por esto que se debe conocer y tener un mayor entendimiento de la gen\u00e9tica detr\u00e1s de las enfermedades mentales, para as\u00ed poder predecir el riesgo de padecer de la enfermedad, predecir c\u00f3mo se desarrolla la enfermedad y tambi\u00e9n poder identificar nuevos objetivos para tratamientos.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Durante la \u00faltima d\u00e9cada, para poder entender de la gen\u00e9tica de las enfermedades mentales, se ha desarrollado un instrumento revolucionario llamado genome-wide association studies, o GWAS por sus siglas. Los GWAS permiten a los investigadores analizar el genoma de distintos individuos y buscar marcadores gen\u00e9ticos para entender c\u00f3mo es que los genes contribuyen a la enfermedad. Los GWAS identifican marcadores gen\u00e9ticos establecidos a trav\u00e9s de todo el genoma de m\u00faltiples individuos. Los marcadores gen\u00e9ticos que utiliza en GWAS son Single nucleotide polymorphisms, o SNPs por sus siglas. Los SNPs son una variaci\u00f3n del genoma en un solo nucle\u00f3tido. Se refiere a los lugares en el genoma que dos individuos son diferentes, o sea, la diferencia entre tu genoma y el mio se debe a los SNPs, y se consideran SNPs si se encuentran en m\u00e1s de 1% de toda la poblaci\u00f3n. Los GWAS recopilan data gen\u00e9tica de individuos con cierta enfermedad, como la depresi\u00f3n, por ejemplo, y de individuos control que no tengan esa enfermedad. Una vez el GWAS recopila esta informaci\u00f3n gen\u00e9tica de todos los individuos en el estudio, se deben analizar los resultados. Esta es la parte m\u00e1s importante, ya que para cada SNP que el GWAS analiza, se establecen estrictos est\u00e1ndares estad\u00edsticos para considerar ese SNP como uno significativo en contribuir a la enfermedad mental. Para que el SNP se considere significativo, el p-value debe ser p&lt;5&#215;10-8. Una vez se obtienen los SNPs que son significativos, estos se pueden visualizar a trav\u00e9s de un manhattan plot y as\u00ed se puede ver los resultados de un GWAS.&nbsp;&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Aunque esto del GWAS es algo relativamente reciente, ya se han hecho m\u00faltiples estudios usando esta herramienta para entender con mayor certeza los genes que pudieran estar contribuyendo a las enfermedades mentales. Uno de los GWAS m\u00e1s amplios y robustos que se han hecho son con pacientes de esquizofrenia. Estudios GWAS de esquizofrenia reportan una asociaci\u00f3n muy significativa en el locus de Major Histocompatibility Complex (o locus MHC, por sus siglas) localizado en el cromosoma 6 con la esquizofrenia. O sea, hay una asociaci\u00f3n entre la esquizofrenia y unos SNPs en el locus MHC en el cromosoma 6. Quiero enfatizar que un SNP NO es una mutaci\u00f3n en el genoma. A partir de estos resultados del GWAS, un art\u00edculo publicado en la prestigiosa revista Nature, pudo relacionar esta asociaci\u00f3n con el locus MHC y la esquizofrenia. En este art\u00edculo que fue publicado en el 2016, se encontr\u00f3 que la asociaci\u00f3n del locus MHC se debe a una desregulaci\u00f3n de la actividad de complemento, que es uno de los genes que se encuentra en ese locus, en el cerebro durante el desarrollo de esquizofrenia. Esto es un gran ejemplo de c\u00f3mo el conocimiento y la investigaci\u00f3n pasa del nivel de los estudios de GWAS para identificar posibles genes que est\u00e1n asociados a una enfermedad mental a entender la neurobiolog\u00eda detr\u00e1s de la enfermedad. En este caso, los estudios GWAS identificaron una asociaci\u00f3n muy significativa entre la esquizofrenia y el locus MHC, y luego se logr\u00f3 entender que la raz\u00f3n biol\u00f3gica de esta asociaci\u00f3n se debe a la desregulaci\u00f3n del sistema inmunol\u00f3gico, espec\u00edficamente de complemento, en el cerebro.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Adem\u00e1s de los estudios GWAS de la esquizofrenia, se han hecho GWAS para poder identificar genes asociados a otras enfermedades psiqui\u00e1tricas. Un estudio GWAS sobre la depresi\u00f3n en una poblaci\u00f3n del Reino Unido identific\u00f3 17 locus significativos asociados a tres fenotipos de depresi\u00f3n. Estos locus contienen genes que codifican para neurotransmisi\u00f3n excitatoria, funciones postsin\u00e1pticas y dendr\u00edticas. Un estudio GWAS sobre la bipolaridad identifico 30 locus significativos asociados a la bipolaridad, que incluyen genes que codifican para canales i\u00f3nicos, transportadores de neurotransmisores y componentes de la sinapsis, aunque este GWAS se hizo a menor escala.&nbsp;&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Aunque el GWAS es una herramienta poderosa para identificar posibles genes asociados a una enfermedad, el GWAS tiene sus limitaciones. Debido a que el GWAS requiere de unos estrictos an\u00e1lisis estad\u00edsticos, tales como que el p-value sea p&lt;5&#215;10-8, se necesita una <em>gran<\/em> muestra para obtener resultados significativos. Mientras m\u00e1s grande sea la muestra, mayor ser\u00e1 el poder estad\u00edstico y mayor probabilidad de identificar alguna variante gen\u00e9tica. Estudios GWAS con muestras peque\u00f1as no identifican asociaciones gen\u00e9ticas con la enfermedad. Otra limitaci\u00f3n que tienen los estudios GWAS es que lo que se utiliza como marcador gen\u00e9tico para analizar el genoma de un individuo, los SNPs, en su mayor\u00eda se encuentran en lugares que no codifican as\u00ed que no tendr\u00edan un efecto a mayor escala en alguna enfermedad mental. Por otro lado, el los estudios GWAS solo identifican asociaciones entre ciertos genes y la enfermedad, no nos dice c\u00f3mo exactamente es que los genes est\u00e1n interactuando para que se desarrolle la enfermedad mental.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Con toda y sus limitaciones, los GWAS han revolucionado la investigaci\u00f3n en la neuropsiquiatr\u00eda. A trav\u00e9s de los GWAS, se ha empezado a recopilar informaci\u00f3n nueva sobre la gen\u00e9tica de los des\u00f3rdenes mentales, proveyendo nuevas oportunidades para desarrollar biomarcadores y nuevos tratamientos. Esto ser\u00eda todo por hoy&#8230; Espero que les haya gustado este episodio, y les exhorto a que sigan buscando informaci\u00f3n sobre los genome-wide association studies. Hasta la pr\u00f3xima!<\/p>\n<\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\" style=\"flex-basis:25%\"><\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Title: &#8220;Genome-wide association&nbsp;studies (GWAS) en la investigaci\u00f3n&nbsp;neuropsiqui\u00e1trica&#8221; By Diego R. Calo L\u00f3pez Diego R. Calo L\u00f3pez University of Puerto Rico, Rio Piedras CampusFaculty: Natural ScienceBaccalaureate: Biology Year: 4th Transcript (in spanish) Saludos a todos y todas los podcast escucha a trav\u00e9s de todo el mundo. 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